Морская трава Джонсона — самая редкая разновидность своего рода. Это растение имеет ограниченное распределение, ограниченную способность рассевания и колонизирования среды обитания из-за своего вегетативного воспроизводства, и зависит от стабильности основания. Количественные данные по разновидностям редки, хотя одно исследование показало, что изобилие всех разновидностей морской травы — на 16 % меньше чем в 1986 году. Долгосрочные потери, как думают, составляют приблизительно 50 % для полного показателя морской травы с 1970-ых годов (Вудворд-Клайд, 1994 г.).
Длительное существование и восстановление морской травы Джонсона могут быть ограничены из-за изменения среды обитания из-за влияния человека и естественных природных нарушений. Эти нарушения включают:
- Повреждение дна пропеллером — Изменение и последующее разрушение бентического сообщества от лодок с пропеллером, который царапает дно, постановка судна на якорь и его швартовка приводят к повреждению участков морской травы Джонсона, в частности, такие действия приводят к разрушению корневой системы растения, разъединенным ризомам, и существенным сокращениям физической стабильности основания.
- Дноуглубительные работы — Выемка грунта водных путей для доступа лодок перераспределяет отложения, хоронит растения и разрушает рельеф дна.
- Штормы и отложение осадка — Эрозионные силы и отложение осадка, связанное с серьезными штормами, вероятно, затрагивает некоторые самые богатые колонии растений, расположенные около входных отверстий в заливы. Во время ураганов штормовая волна может перераспределить отложения, таким образом, разрушая или хороня под илом существующие колонии растений. Заиливание из-за человеческого вмешательства и методов использования земли может также угрожать жизнеспособности разновидностей.
- Ухудшение качества воды — Питательное обогащение, вызванное неорганическим и органическим азотом и фосфором через использование городской и пахотной земли, может стимулировать увеличение водорослевого роста и прекратить развитие морской травы Джонсона, затеняя эту разновидность и уменьшая содержание кислорода в воде.
Исследование продолжается, и ученые пытаются выяснить, что необходимо для того, чтобы успешно вырастить разновидности в неволе и пересадить их в подходящие места в открытом море. План восстановления также предполагает продолжение исследования относительно основной репродуктивной биологии и истории жизни разновидностей, а также общего управления и координации среди ответственных местных, государственных, и федеральных агентств. 15 сентября 1993 года, NMFS призвал к тому, чтобы морскую траву Джонсона причислить к списку растений, которым угрожает исчезновение, согласно закону о Вымирающих видах (ESA). 4 августа 1994 года было впоследствии предложено ввести обозначение критической среды обитания. Морская трава Джонсона была внесена в Список растений, которым угрожает исчезновение 14 сентября 1998 года, а 5 апреля 2000 года была определена критическая среда обитания. 4 октября 2002 года был издан План восстановления колоний этого растения.
